Jeunes Chercheurs Associés
Nathalie D

Docteur·e - Microbiologie (Virologie)

  • Microbiologie, micro-organismes
  • Virus, virologie
  • Biologie moléculaire, génétique, épigénétique, génomique
  • Amplification en chaîne par polymérase (PCR)
  • Séquençage (biologie moléculaire)

Ses capacités d’intervention

Région Île-de-France
Pays de la Loire

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En quelque mots

Je suis ingénieure en biologie moléculaire principalement spécialisée en virologie. Je suis passionnée par la recherche scientifique et la transmission des connaissances. Après avoir obtenu un BTS en analyses biologiques, j’ai souhaité m’orienter vers la recherche et me suis spécialisée en virologie jusqu’à l’obtention d’un doctorat à Paris VII. Mon domaine d'expertise s'articule autour de trois axes : une recherche clinico- virologique, une recherche fondamentale en génomique virale et une expertise en bio-informatique. J’apprécie particulièrement être à l’interface entre la recherche fondamentale et la recherche clinique favorisant le transfert des avancées de la recherche au domaine hospitalier. J'aime également transmettre et expliquer les principes des techniques de biologie moléculaire, de virologie et de bio-informatique aux étudiants et cliniciens avec qui je collabore.

Sa thèse

Intitulé de la thèse : Intérêt de la mutagenèse dirigée et de la quantification des virus persistants dans le contexte de l’infection à VIH

Universités et laboratoires d’appartenance ou d’origine :

Sorbonne Université Genset Laboratoire de virologie-APHP

Ses expériences universitaires

New Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus variant in men who have sex with men associated with severe pathologies. J Infect Dis. 2020 Sep 14;222(8)

Characterization update of HIV-1 M subtypes diversity and proposal for subtypes A and D sub-subtypes reclassification.Retrovirology.2018 Dec 22;15(1)

). Evaluation of different analysis pipelines for the detection of HIV-1 minority resistant variants. PLoS ONE 1. 2018 Jun 1;13 (6)

Ses expériences professionnelles

Ingénieure d'études en techniques biologiques, SIRIC CURAMUS, Sorbonne Université 08/2019 - en cours

Développement de pipelines d’analyse RNAseq dans le cancer du Pancréas
Analyse des répertoires lymphocytaires
Analyse du micro-environnement tumoral
Détermination de néo-épitopes
Détermination du typage HLA
Programmation: BASH, Python


Ingénieure d'études en techniques biologiques, Equipe Théravir, Sorbonne Université 11/2015 - 07/2019

Détection d’un nouveaux variant génomique de l’HHV8
Etudes de l’évolution de la classification des génomes viraux du HIV-1
Analyses bio-informatiques de séquençage NGS
Détection de mutations de résistances du HIV-1 aux antirétroviraux
Phylogénie


Technicienne de recherche en biologie moléculaire, ER1-DETIV, Université Paris VI 10/1997 - 11/2015

Mise en place de différentes techniques de biologie moléculaire. PCR, Séquençage, Clonage, mutagénèse dirigée, production de protéines ect....
Formation des techniciens et biologistes en biologie moléculaire

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