Tiffany D
Docteur·e - Génomique/bioinformatique
- Biologie moléculaire, génétique, épigénétique, génomique
- Cancer, tumeurs, oncologie, cancérologie
- Bioinformatique
- Analyse statistique de données, analyse factorielle, en composantes principales
- Inférence statistique, tests statistiques, sondages, intervalles de confiance
- Calcul haute performance (HPC)
Ses capacités d’intervention
Région
Auvergne-Rhône-Alpes
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Docteure en génomique/bioinformatique du cancer, je suis passionnée par l'enseignement et la recherche en santé, avec pour but d’améliorer la prise en charge des patients atteins d'un cancer. Diplômée d'une licence et d'un master de l'université Lyon 1 en génomique évolutive et bioinformatique, j'ai par la suite validé un master à l'ENS de Lyon en informatique théorique et modélisation des systèmes complexes. J'ai ensuite eu la chance d'effectuer ma thèse dans un laboratoire de génétique du cancer au Centre International de Recherche sur le Cancer (CIRC/WHO), à Lyon, que j'ai obtenue en 2019. Mes travaux se basaient sur le développement et l'application de méthodes de calculs appliquées au données de séquençage NGS dans le cadre de la détection précoce des cancers à partir de biopsies liquides. J'ai ensuite intégré jusqu'en Janvier 2023 un laboratoire de l'IRB à Barcelone en Espagne en tant que chercheuse post-doctorante, avec l'objectif de comprendre comment des mécanismes endogènes et exogènes peuvent impacter les processus mutationnels de l'ADN dans les tissues, et conduire à des cancers.Sa thèse
Intitulé de la thèse : Using the systematic nature of errors in NGS data to efficiently detect mutations : computational methods and application to early cancer detection
Universités et laboratoires d’appartenance ou d’origine :
Circ (OMS) IRB BarcelonaSes expériences universitaires
article de thèse en premier auteur: Needlestack: an ultra-sensitive variant caller for multi-sample next generation sequencing,
CV avec liste des publications: https://github.com/tdelhomme/curriculum/blob/master/cv.pdf
Ses expériences professionnelles
Travaux de recherche sur deux sujets : impact des processus endogènes et exogènes sur les tissus somatiques humains.
Co-supervision d'une étudiante en thèse. Sujet: Optimisation de l'alignement de lectures longues issues du séquençage NGS
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